Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prkd3Q8K1Y2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkd3Q8K1Y2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms