Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1M4

Glis1, Zinc finger protein GLIS1, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis1Q8K1M4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Glis1Q8K1M4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Glis1Q8K1M4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms