Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm17Q8JZX4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rbm17Q8JZX4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm17Q8JZX4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 234.9 ms