Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIN6

Celf3, CUGBP Elav-like family member 3, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf3Q8CIN6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Celf3Q8CIN6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Celf3Q8CIN6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms