Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brf1Q8CFK2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brf1Q8CFK2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
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