Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI7

Polr2b, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2bQ8CFI7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2bQ8CFI7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2bQ8CFI7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms