Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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9030612E09RikQ8CE20 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
9030612E09RikQ8CE20 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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9030612E09RikQ8CE20 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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9030612E09RikQ8CE20 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
9030612E09RikQ8CE20 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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9030612E09RikQ8CE20 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
9030612E09RikQ8CE20 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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9030612E09RikQ8CE20 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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9030612E09RikQ8CE20 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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9030612E09RikQ8CE20 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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9030612E09RikQ8CE20 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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9030612E09RikQ8CE20 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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9030612E09RikQ8CE20 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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9030612E09RikQ8CE20 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9030612E09RikQ8CE20 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
9030612E09RikQ8CE20 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
9030612E09RikQ8CE20 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9030612E09RikQ8CE20 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9030612E09RikQ8CE20 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9030612E09RikQ8CE20 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9030612E09RikQ8CE20 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
9030612E09RikQ8CE20 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
9030612E09RikQ8CE20 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9030612E09RikQ8CE20 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9030612E09RikQ8CE20 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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9030612E09RikQ8CE20 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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9030612E09RikQ8CE20 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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9030612E09RikQ8CE20 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9030612E09RikQ8CE20 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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