Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ufl1Q8CCJ3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ufl1Q8CCJ3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms