Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7U1

N4bp3, NEDD4-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp3Q8C7U1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
N4bp3Q8C7U1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms