Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C708 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C708 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C708 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C708 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C708 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C708 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C708 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C708 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C708 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C708 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C708 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C708 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C708 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C708 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C708 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C708 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C708 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C708 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8C708 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8C708 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8C708 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8C708 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8C708 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8C708 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8C708 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C708 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C708 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C708 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C708 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C708 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C708 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C708 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C708 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C708 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C708 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C708 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C708 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C708 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C708 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C708 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C708 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C708 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C708 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C708 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C708 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C708 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C708 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C708 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C708 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C708 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C708 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C708 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C708 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C708 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8C708 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8C708 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8C708 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8C708 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8C708 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8C708 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8C708 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8C708 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C708 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C708 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C708 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C708 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C708 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C708 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C708 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C708 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C708 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C708 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C708 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C708 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C708 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8C708 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8C708 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8C708 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8C708 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8C708 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8C708 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8C708 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C708 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C708 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C708 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C708 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C708 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C708 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C708 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C708 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C708 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C708 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C708 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C708 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C708 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C708 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C708 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C708 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C708 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms