Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc113Q8C5T8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc113Q8C5T8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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