Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cwc22Q8C5N3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Cwc22Q8C5N3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms