Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sfrp1Q8C4U3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfrp1Q8C4U3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfrp1Q8C4U3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfrp1Q8C4U3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfrp1Q8C4U3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfrp1Q8C4U3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfrp1Q8C4U3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfrp1Q8C4U3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfrp1Q8C4U3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfrp1Q8C4U3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfrp1Q8C4U3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfrp1Q8C4U3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfrp1Q8C4U3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfrp1Q8C4U3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfrp1Q8C4U3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfrp1Q8C4U3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfrp1Q8C4U3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sfrp1Q8C4U3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sfrp1Q8C4U3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sfrp1Q8C4U3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sfrp1Q8C4U3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sfrp1Q8C4U3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sfrp1Q8C4U3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sfrp1Q8C4U3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sfrp1Q8C4U3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms