Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4J0

Ccdc60, Coiled-coil domain-containing protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc60Q8C4J0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc60Q8C4J0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc60Q8C4J0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc60Q8C4J0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc60Q8C4J0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc60Q8C4J0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc60Q8C4J0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc60Q8C4J0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc60Q8C4J0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc60Q8C4J0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc60Q8C4J0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc60Q8C4J0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc60Q8C4J0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc60Q8C4J0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc60Q8C4J0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc60Q8C4J0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc60Q8C4J0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc60Q8C4J0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc60Q8C4J0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc60Q8C4J0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc60Q8C4J0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc60Q8C4J0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc60Q8C4J0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc60Q8C4J0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc60Q8C4J0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc60Q8C4J0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc60Q8C4J0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc60Q8C4J0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc60Q8C4J0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc60Q8C4J0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc60Q8C4J0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc60Q8C4J0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc60Q8C4J0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc60Q8C4J0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc60Q8C4J0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc60Q8C4J0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc60Q8C4J0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms