Protein–RNA interactions for Protein: Q8C159

Ttc22, Tetratricopeptide repeat protein 22, mousemouse

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc22Q8C159 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Ttc22Q8C159 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Ttc22Q8C159 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Ttc22Q8C159 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Ttc22Q8C159 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Ttc22Q8C159 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Ttc22Q8C159 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Ttc22Q8C159 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttc22Q8C159 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Ttc22Q8C159 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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Ttc22Q8C159 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Ttc22Q8C159 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc22Q8C159 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms