Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Strip1Q8C079 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Strip1Q8C079 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms