Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim35Q8C006 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim35Q8C006 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim35Q8C006 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim35Q8C006 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim35Q8C006 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim35Q8C006 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim35Q8C006 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim35Q8C006 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim35Q8C006 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
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