Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdsp2Q8BX07 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Ctdsp2Q8BX07 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Ctdsp2Q8BX07 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdsp2Q8BX07 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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