Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN0

Ccdc122, Coiled-coil domain-containing protein 122, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc122Q8BVN0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc122Q8BVN0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc122Q8BVN0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms