Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod1Q8BVA4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmod1Q8BVA4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms