Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Pggt1bQ8BUY9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Pggt1bQ8BUY9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pggt1bQ8BUY9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pggt1bQ8BUY9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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