Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTY8

Scfd2, Sec1 family domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scfd2Q8BTY8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scfd2Q8BTY8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms