Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps6kb1Q8BSK8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rps6kb1Q8BSK8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rps6kb1Q8BSK8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rps6kb1Q8BSK8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rps6kb1Q8BSK8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rps6kb1Q8BSK8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rps6kb1Q8BSK8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rps6kb1Q8BSK8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rps6kb1Q8BSK8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rps6kb1Q8BSK8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rps6kb1Q8BSK8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rps6kb1Q8BSK8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rps6kb1Q8BSK8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rps6kb1Q8BSK8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rps6kb1Q8BSK8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms