Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMV6

E130116L18Rik, RIKEN cDNA E130116L18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130116L18RikQ8BMV6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
E130116L18RikQ8BMV6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms