Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ckap4Q8BMK4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ckap4Q8BMK4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ckap4Q8BMK4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ckap4Q8BMK4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ckap4Q8BMK4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ckap4Q8BMK4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ckap4Q8BMK4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ckap4Q8BMK4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ckap4Q8BMK4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ckap4Q8BMK4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ckap4Q8BMK4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ckap4Q8BMK4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap4Q8BMK4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ckap4Q8BMK4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ckap4Q8BMK4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap4Q8BMK4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap4Q8BMK4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap4Q8BMK4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap4Q8BMK4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap4Q8BMK4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap4Q8BMK4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap4Q8BMK4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap4Q8BMK4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap4Q8BMK4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap4Q8BMK4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap4Q8BMK4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms