Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gga3Q8BMI3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gga3Q8BMI3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gga3Q8BMI3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms