Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcal1Q8BJL0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarcal1Q8BJL0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms