Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Katnb1Q8BG40 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Katnb1Q8BG40 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms