Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tnpo1Q8BFY9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnpo1Q8BFY9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnpo1Q8BFY9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms