Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc50Q810U5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms