Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Ttc28Q80XJ3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Ttc28Q80XJ3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Ttc28Q80XJ3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ttc28Q80XJ3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ttc28Q80XJ3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ttc28Q80XJ3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ttc28Q80XJ3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ttc28Q80XJ3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ttc28Q80XJ3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc28Q80XJ3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc28Q80XJ3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ttc28Q80XJ3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ttc28Q80XJ3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc28Q80XJ3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ttc28Q80XJ3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc28Q80XJ3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc28Q80XJ3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc28Q80XJ3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc28Q80XJ3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc28Q80XJ3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc28Q80XJ3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc28Q80XJ3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms