Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ell3Q80VR2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ell3Q80VR2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ell3Q80VR2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ell3Q80VR2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ell3Q80VR2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ell3Q80VR2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ell3Q80VR2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ell3Q80VR2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ell3Q80VR2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ell3Q80VR2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ell3Q80VR2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 233.7 ms