Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc155Q80VJ8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc155Q80VJ8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms