Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otop3Q80UF9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otop3Q80UF9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otop3Q80UF9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms