Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Phf8Q80TJ7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms