Protein–RNA interactions for Protein: Q80ST9

Lca5, Lebercilin, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5Q80ST9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lca5Q80ST9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lca5Q80ST9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms