Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ifna12Q80SS5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifna12Q80SS5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms