Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccp110Q7TSH4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccp110Q7TSH4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccp110Q7TSH4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms