Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctdp1Q7TSG2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdp1Q7TSG2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms