Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dsg1bQ7TSF1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Dsg1bQ7TSF1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms