Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dsg1cQ7TSF0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dsg1cQ7TSF0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms