Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphp3Q7TNH6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nphp3Q7TNH6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp3Q7TNH6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms