Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Shq1Q7TMX5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Shq1Q7TMX5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Shq1Q7TMX5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms