Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Abcg2Q7TMS5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcg2Q7TMS5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms