Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Uhrf2Q7TMI3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uhrf2Q7TMI3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms