Protein–RNA interactions for Protein: Q7JJ13

Brd2, Bromodomain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd2Q7JJ13 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Brd2Q7JJ13 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Brd2Q7JJ13 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brd2Q7JJ13 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brd2Q7JJ13 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brd2Q7JJ13 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brd2Q7JJ13 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brd2Q7JJ13 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd2Q7JJ13 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms