Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snd1Q78PY7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snd1Q78PY7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms