Protein–RNA interactions for Protein: Q78IK2

Usmg5, Up-regulated during skeletal muscle growth protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usmg5Q78IK2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usmg5Q78IK2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usmg5Q78IK2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms