Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd3eapQ76KJ5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd3eapQ76KJ5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms