Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnih3Q6ZWS4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnih3Q6ZWS4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms